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生物資訊

細(xì)菌耐藥機(jī)理及其耐藥細(xì)菌的檢測(cè)與臨床

作者:admin 來源:本站 發(fā)布時(shí)間: 2011-02-27 21:31  瀏覽次數(shù):
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一、全球面臨主要細(xì)菌耐藥問題
•  MRS(Methicilln-Resistant Stapylococci) 耐甲氧西林葡萄球菌包括MRSA,MRSE等。
•  VIA(Vancomycin-Intermediate Staphyococcus Aurus) 萬古霉素中介的金葡菌
•  VRE(Vancomycin-Resitant Enterococci) 萬古霉素耐藥的腸球菌
•  ESBL(Extended-Spectrum B-lactamse) 超廣譜酶(大腸/肺克)
•  Inducible Ampc (Ampc基因突變,高產(chǎn)量,50%左右三代頭孢耐藥) 陰溝、產(chǎn)氣、聚團(tuán)等腸桿菌屬。
•  Non-Fementatives(非發(fā)酵菌) 銅綠、不動(dòng)、嗜麥芽
•  PRP(Penicillin-Resistant S、P) 青霉素耐藥的肺炎球菌。
耐藥的主要機(jī)理
•  .產(chǎn)生滅活酶 .靶位改變 低通性屏障作用(膜通透性下降及生物被膜) .主動(dòng)外運(yùn)
•  .細(xì)胞缺乏自溶酶,對(duì)抗菌藥物產(chǎn)生耐受性
對(duì)各類抗生素的主要耐藥機(jī)制
•  抗菌藥物   耐藥機(jī)制  
•  β-內(nèi)酰胺類  細(xì)胞壁通性降低,與PBPs親和力與結(jié)合力降低,產(chǎn)B-內(nèi)酰胺酶,自溶  
•  氨基甙類  攝入減少,產(chǎn)鈍化酶,核糖體30S亞基改變,EH下降和PH下降,降低氨基甙活性  
•  大環(huán)內(nèi)脂類  核糖體50S亞基改變,局部PH下降可降低活性  
•  四環(huán)素類  藥物外流加快,細(xì)菌體內(nèi)積蓄減少,核糖體30S亞基 改變,產(chǎn)生滅活酶  
•  氯霉素  攝入減少,產(chǎn)生氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶  
•  林可類  核糖體50S亞基改變  
•  萬古霉素  不易產(chǎn)生耐藥性  
•  喹諾酮類  細(xì)胞外膜OMPF降低,攝入減少,膜傳導(dǎo)通道改變胞內(nèi)積蓄減少等
產(chǎn)生滅活酶是最多見的耐藥機(jī)制,可通過細(xì)菌的基因突變引起,最主要是從其他細(xì)菌通過轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo),結(jié)合,異位而獲得。最主要的滅活酶有二類:一類為ß-內(nèi)酰胺酶,另一類為氨基甙類鈍化酶。
一、β-內(nèi)酰胺酶:
•   主要分類方法有二種 a.分子生物學(xué)分類:根據(jù)末端氨基酸序列及編碼基因位點(diǎn)(見圖1)
•  b.功能分類:根據(jù)酶等電點(diǎn)、水解底物、是否被酶抑制劑所抑制及分子結(jié)構(gòu)類別(見表1表2)
表一 1998年Bush分類
ß -內(nèi)酰胺酶種類   克拉維酸、舒巴坦作用
•  Group1:頭孢菌素酶 (誘導(dǎo)酶) 不能抑制
•  Group2a:青霉素酶 能抑制
•  Group2b:廣譜酶 能抑制
•  Group2b’:超廣譜酶 能抑制
•  金屬酶:   不能抑制
超廣譜ß -內(nèi)酰胺酶(Estended-spectrum ß -latamases,ESBLs)
ESBLs是質(zhì)粒介導(dǎo)的,為TEM-1,TEM-2和SHV-1的突變酶,包括TEM-3到TEM-26,SHV-2SHV-6共近30種,與TEM-1,TEM-2和SHV-1相比,僅有1到4個(gè)氨基酸的不同,由在分子質(zhì)粒編碼的,質(zhì)粒分子量大約在23Kbs到100Kbs之間,能夠被棒酸所抑制,屬于A類酶(分子生物學(xué)分類),可以通過結(jié)合試驗(yàn)轉(zhuǎn)給敏感菌,1983年,歐洲KnotheH在肺炎克雷轉(zhuǎn)給敏感菌,1983年,歐洲KnotheH在肺炎克雷伯桿菌中發(fā)現(xiàn)了這種能滅活三代頭孢菌素的SHV-1衍生物,現(xiàn)已在英國(guó)引起多次的醫(yī)院感染爆發(fā)流行。
產(chǎn)ESBLs菌株的耐藥特點(diǎn):廣譜酶(TEM-1,TEM-2,SHV-1)主要滅活青霉素和窄譜頭孢菌素(一、二代頭孢),三代頭孢菌素對(duì)其穩(wěn)定,而ESBLs能分解三代頭孢(頭孢噻肟、頭孢他啶、頭孢哌酮、頭孢曲松)以及單環(huán)酰胺類的氨曲能,但大多數(shù)產(chǎn)ESBLs菌株對(duì)復(fù)合三代頭孢(如舒普深)敏感,幾乎所有ESBLs菌株對(duì)泰能敏感。
產(chǎn)ESBL菌株的治療
•  碳青霉烯類   首選藥物  
•  β-內(nèi)酰胺類 首選有效(必須給予相當(dāng)高的劑量)
抗生素與β-內(nèi)酰胺酶抑制劑 復(fù)合制劑
•  喹諾酮類 如果藥敏結(jié)果顯示敏感則可
氨基糖甙類 能有效 SMZco(復(fù)方新諾明)
產(chǎn)ESBL菌株的治療
•  至今,有證據(jù)建議:經(jīng)驗(yàn)治療可能產(chǎn)ESBLs株導(dǎo)致的感染必須包括一個(gè)碳青霉烯類抗生素聯(lián)合應(yīng)用一個(gè)氨基糖甙類抗生素,直到細(xì)菌敏結(jié)果知道時(shí)。
 
 
 根據(jù)臨床藥敏報(bào)告進(jìn)行推測(cè) 對(duì)多種三代頭孢菌素耐藥的需考慮產(chǎn)ESBL有可能(現(xiàn)在有一種共識(shí)即若確定為產(chǎn)ESBL菌株,即使普通三代頭孢及氨曲能藥敏是敏感的也要報(bào)耐藥)。
適用于治療ESBL株的抗生素藥 碳青霉烯類 復(fù)合三代頭孢菌素(但需劑量大一點(diǎn),注意Ampc基因) 
阿米卡星(不同地區(qū)可不一致)
幾種新的ß-內(nèi)酰胺酶
耐酶抑制劑廣譜酶(IRT,IRBLs,18種)
水解氨芐西林、羧芐西林,對(duì)哌拉西林和頭孢類仍敏感 
克拉維酸、舒巴坦的抑制效果不好,舒巴坦對(duì)IRT最差
他唑巴坦仍有抑制作用 哌拉西林/他唑巴坦復(fù)方仍有活性作用
酶抑制劑:1克拉維酸、舒巴坦、他唑巴坦. 2.TEM型 三種均有抑制作用,作用相仿
3.SHV型 他唑巴坦、克拉維酸強(qiáng)于舒巴坦 4.產(chǎn)酶細(xì)菌對(duì)酶抑制劑不敏感的原因
1)TEM-1產(chǎn)量過多 2)外膜蛋白改變 3)1型酶(AmpC)
4)1 2 型酶并存 5)2br(IRT) 6)2d(OXA-11)
TYPE β-Lac
概述:產(chǎn)生機(jī)制 染色體上的amp(通常處于被抑制狀態(tài)) 突變 去阻遏活化編碼產(chǎn)生AmpC酶
誘導(dǎo)機(jī)制 BPBs4,7a,7b(Sanders CC,1977)
近來還發(fā)現(xiàn)質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC酶
來源:染色體上的AmpC轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒,使ECO和KPN的臨床分離株獲得質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC酶。
此外可見于:Salmonella spp ,P.Mirabilis.C.freundii。
染色體上的基因來自腸桿菌屬、枸櫞酸桿菌屬和假單胞菌屬。
已報(bào)告17種,其中出現(xiàn)最多、分布最廣的是CMY-2
特點(diǎn): 往往在抗生素治療過程中誘導(dǎo)產(chǎn)生,并有可能選擇出持續(xù)、大量產(chǎn)酶的耐藥菌株(去阻遏突變株)
?  IMP是許多潛在的酶誘導(dǎo)劑之一,但沒有選擇去阻遏突變株的作用。
?  許多3-ceph是弱誘導(dǎo)劑,但有選擇去阻遏突變株的作用。
臨床意義:隨著新型頭孢菌素的使用增加,能產(chǎn)生type1 β-Lac,導(dǎo)致對(duì)β-內(nèi)酰胺類多重耐藥的菌株迅速出現(xiàn)并成為醫(yī)院感染的重要病原菌。
?  ICU和灼傷等重癥患者對(duì)腸桿菌、沙雷菌和銅綠假單胞菌等能產(chǎn)生TYPE 1β-Lac的細(xì)菌高度易感,成為上述病區(qū)的嚴(yán)重問題。
?  只有嚴(yán)格控制三代頭孢菌素的使用,才能控制這一嚴(yán)重問題。
治療: 碳青霉烯類 四代頭孢菌素:頭孢吡肟、頭孢匹羅
小結(jié):1.AmpC酶(Bush1型酶)可引起GNB對(duì)三代頭孢菌素和單酰胺類抗生素的耐藥。對(duì)抑制劑不敏感,對(duì)IMP敏感。2.AmpC酶具有一定的誘導(dǎo)性3.AmpC酶不僅可由染色體且可由質(zhì)粒介導(dǎo)。4.AmpC表達(dá)的調(diào)控機(jī)制未明,據(jù)認(rèn)為與ampR、ampD、ampE、ampG有關(guān)。
氨基糖甙類鈍化酶
1.氨基糖甙類抗生素對(duì)鈍化酶穩(wěn)定性不同,耐藥率不同 2.慶大穩(wěn)定性較差,耐藥率高
3.阿米卡星、奈替米星穩(wěn)定性高,耐藥率低 4.尤其是奈替米星,對(duì)50%以上的慶大藥株有效
•  氨基甙類鈍化酶:磷酸轉(zhuǎn)移酶、乙酰轉(zhuǎn)移酶、核苷轉(zhuǎn)移酶
氯霉素乙?;?紅霉素-O-磷酸化酶;克林霉素-O-核苷化酶.
二、靶位改變
(1)原有靶位的親和力改變 PRP:PBP1a,2a,2b,2x的親和力下降,造成對(duì)青霉素及頭孢菌素耐藥
(2)出現(xiàn)新的替代途徑 8TKDa----PBP1---- 80 ----PBP2----PBP2a(PBP,278Kda)
75 ----PBP,3---- 70 ----PBP3---- 41 ----PBP4----
(3)任何抗菌藥物均可由靶位改變產(chǎn)生耐藥。
三、.低通透性屏障作用
(1)外膜通透性降低
a.孔蛋白(Porin)組成及數(shù)量改變有關(guān)大腸埃希菌OmpF和OmpC (耐藥OmpF下降)
b.D2微孔蛋白(47KDa)
(2)生物被膜(Biofilm)的形成
a.BF組成:多糖基質(zhì)、纖維蛋白、脂蛋白等
b.BF與細(xì)菌耐藥 休眠狀態(tài),膜通透性下降; BF屏障作用 BF吸附滅活菌
BF吸附抗菌藥物 BF使細(xì)菌獲得足夠時(shí)間,開啟耐藥基因
四、主動(dòng)外運(yùn)
操縱于MexA-MexB-OprM編號(hào)的三種蛋白組成的復(fù)合體。
MexA-40KD質(zhì)膜蛋白(膜融合蛋白) MexB-108KD主動(dòng)外運(yùn)蛋白 OprM-50KD外膜蛋白 
四、細(xì)菌耐藥性的變遷
細(xì)菌耐藥性隨著時(shí)代的變遷,其中最重要的一個(gè)原因是抗藥藥物的濫用,篩選出耐藥株,并增加細(xì)菌突變的壓力。因此必須了解細(xì)菌耐藥狀況,選擇合理抗菌藥物進(jìn)行治療。
 
五、常見細(xì)菌耐藥及治療
(一)肺炎球菌(鏈球菌屬的問題)
注意青霉素耐藥問題(國(guó)內(nèi)約5%)
(1)青霉素MIC測(cè)定
敏感   中介(低耐)用   耐藥  .
MIC≤0.06mg/L   0.12∽1mg/L   ≥2mg/L 
(2)耐藥機(jī)理: 未發(fā)現(xiàn)產(chǎn)B-內(nèi)酰胺酶菌株 耐藥是由于靶位改變即PBP2b,2x親和力下降
(3)治療 大劑量青霉素 高劑量阿莫西林 頭孢噻肟 頭孢曲松 萬古(去甲萬古) 利福平
(二)耐甲氧西林葡萄球菌(MRS)
•  定 義:耐甲氧西林、耐苯唑西林且多重耐藥的葡萄球菌。
•   耐藥機(jī)理:MecA編碼PBP2a及PBPs改變。
•   意義:對(duì)目前所有的β-內(nèi)酰胺類耐藥,通常對(duì)氨基甙類、大環(huán)內(nèi)酯類、克林霉素和四環(huán)素多重耐藥。
•   治療:1.MRS輕度感染 利福平 ,SMZ- TMP,環(huán)丙沙星; 2.MRS嚴(yán)重全身感染 首選萬古霉素
(三)、腸球菌
注意是否對(duì)慶大霉素高耐,是否耐萬古霉素。
(1)慶大高耐:慶大MIC≥1000mg/L 萬古耐藥:萬古MIC≥4mg/L
萬古耐藥方式:VanA(萬古、替考拉寧R), VanB (萬古R,替考拉寧S) 
(2)耐藥機(jī)理: 慶大高耐:產(chǎn)APH (2,)-AAC (6,)氨基甙鈍化酶耐萬古:粘肽結(jié)構(gòu)靶位改變(D-丙氨酰-D-丙氨酸被D-丙氨酰-D乳酸取代)
(3)治療 基本治療方式是青霉素或氨芐西林+慶大霉素。
慶大高耐:需用萬古或去甲萬古,有時(shí)加用利福平。 萬古耐藥:目前尚無有效治療方法。
VanA:非R,非氨基甙高R 青或氨芐+慶大:青R,非氨基甙高R 頭孢曲松+慶大,環(huán)丙沙星+慶大
VanB:非氨基甙高R 替考拉寧+慶大霉素, 氨基甙高R 替考拉寧+氟喹諾酮
多重耐藥腸球菌 鏈陽菌素(Streptogramin)
注意事項(xiàng):腸球菌對(duì)頭孢菌素、氨基甙類、克林霉素和TMP/SMZ可在體外顯示活性但臨床無效。因此上述藥物在此禁止使用。
(四)銅綠假單胞菌
膜通透性低,生物被膜,產(chǎn)生各種滅活酶及主動(dòng)外排系統(tǒng)對(duì)許多抗菌藥物自然耐藥,僅下列藥物可供選擇: 哌拉西林、特美汀、他唑西林、頭孢哌銅、舒普深、頭孢他啶、氨曲能、泰能、 環(huán)丙沙星、氧氟沙星、奈替米星、阿米卡、妥布霉素。 可單用或聯(lián)合應(yīng)用上述藥物。
從國(guó)內(nèi)外耐藥調(diào)查的資料看,對(duì)綠膿桿菌作用最強(qiáng)的是泰能與頭孢他啶,且泰能與其它抗)銅綠假單胞菌藥物間一般不會(huì)出現(xiàn)交叉耐藥,是由于)銅綠假單胞菌對(duì)泰能的耐藥主要是碳青霉烯類的特異通道(47KD的D2微孔蛋白)的關(guān)閉和金屬酶的產(chǎn)生。
(五)大腸桿菌和肺克
產(chǎn)各種B-內(nèi)酰胺酶比例幾乎為100%,成對(duì)B-內(nèi)酰胺抗生素不同程度耐藥。
1)產(chǎn)青霉素酶:分解阿模西林或青霉素等,用復(fù)合青霉素等。
2)頭孢菌素酶:主要分解的是一.二代頭孢,一.二代頭孢大多耐藥,加酶抑制劑能逆轉(zhuǎn),三代頭孢.頭霉素敏感。
3)廣譜酶(TEM-1,2,SHV-1):分解青霉素類、二代頭孢,能被酶抑制逆轉(zhuǎn)
4)ESBL(超廣譜酶):能分解青霉素類、頭孢菌素類及氨曲,一旦確定為產(chǎn)ESBL,青霉素類,頭孢類及氨曲南均報(bào)耐藥,主要出現(xiàn)在院內(nèi)感染菌株。
2.再了解一下國(guó)外對(duì)三代頭孢耐藥的大腸與肺克的相關(guān)資料
CAZ-R的克雷伯菌菌血癥的危險(xiǎn)因素
特點(diǎn)  血中分離菌  
   CAZ-R(31)CAZ-S(31)  P7  
養(yǎng)老院住戶   15   3   0.009  
封閉導(dǎo)尿管    25   5   <0.00001  
G+J管   14   1   0.0004  
中心靜脈插管   27  11   0.0001  
事先用過抗生素   20   8   0.001  
頭孢他啶或胺曲南 11   0   0.009  
CAZ-R克雷伯菌的交叉耐藥
   1990   1993  
慶大/妥布   62%   73%  
喹諾酮   39.8%   51.8%  
在CAZ-S克雷伯菌   <5%   <5%
這種高發(fā)的交叉耐藥性是這種細(xì)菌難于治療的原因之一。例如,在1993年,耐頭孢他啶的克雷伯菌中,73%的菌株耐慶大霉素或妥布霉素,而超過半數(shù)的菌株耐喹諾酮類。相反,在對(duì)頭孢他啶敏感的克雷伯菌中,同時(shí)兩個(gè)藥的耐藥率都很低。
在72小時(shí)菌血癥期間,在適當(dāng)治療和無適當(dāng)治療的帶有頭孢他啶耐藥的病人的結(jié)局.很多情況下我們很難證實(shí)細(xì)菌的MIC值與所選用抗生不比療效之間具有明確的關(guān)系。但是這項(xiàng)研究,此關(guān)系得到證實(shí),因?yàn)樵谶@些耐頭孢他啶的菌癥病人中,適當(dāng)治療的結(jié)局要比后來證實(shí)為不適治療的結(jié)局好。在適當(dāng)治療病人中,18/19存活;相反,事后證實(shí)為不適當(dāng)治療即使用了三代頭孢菌的病人中,5/12人死亡,2組間具有顯著差異。適治療組使用的亞胺培南聯(lián)合或不聯(lián)合氨基糖甙類。整篇文章證明,碳青霉烯類抗生素是治療ESBL的最好藥物。
 
 
 四代頭孢:頭孢吡肟/頭孢匹羅對(duì)I型酶高活性是由于:快速穿過外膜蛋白對(duì)I型酶穩(wěn)定對(duì)PBP高親和力但許多產(chǎn)ESBL的菌株耐四代頭孢菌素,所以用它們治療產(chǎn)ESBL株的感染是不安全的。
六、志賀菌屬、沙門菌屬
•  注意:不應(yīng)報(bào)告選用一、二代頭孢及氨基糖甙類,因?yàn)轶w外實(shí)驗(yàn)可表現(xiàn)有活性,但臨床無效。
八、嗜麥芽窄食單孢菌
•  對(duì)泰能天然耐藥,可供選擇的有:SMZco,阿米卡星,特美丁,喹諾酮類。
九、不動(dòng)桿菌
對(duì)一、二代頭孢,半合成廣譜青霉素,慶大霉素耐藥率達(dá)70-80%,對(duì)三代頭孢菌素可達(dá)50%,但這是條件致病菌,一般出現(xiàn)于院內(nèi)感染,主要是三代頭孢選擇壓力產(chǎn)生。治療上至少選用復(fù)合三代頭孢,但以泰能、阿米卡星、環(huán)丙沙星敏感率較高。
十、腸桿菌屬細(xì)菌
主要包括陰溝、聚團(tuán)、產(chǎn)氣腸桿菌的菌種。
重要耐藥G-菌產(chǎn)I型B-內(nèi)酰胺酶(誘導(dǎo)酶)
•  100%  綠膿桿菌   100%  吲哚(+)變形桿菌   80%   腸桿菌屬  
•  80%   枸櫞酸菌屬   80%   沙雷菌屬  
腸桿菌屬及其它腸桿菌科細(xì)菌
一   對(duì)氨芐西林耐藥率55-94%,氨芐西林+舒巴坦耐藥率為12.6-73%。腸桿菌科細(xì)菌對(duì)頭孢唑啉耐藥率為36-48%,但摩根菌屬,枸櫞酸菌屬、普通變形桿菌耐藥率高達(dá)80-100%,對(duì)頭孢呋辛耐藥率為30-50%,腸桿菌屬、沙雷菌屬、枸櫞酸菌屬幾乎100%耐藥,治療上需選氨基糖甙類、碳青霉烯類(如:泰能)、氟喹諾酮等。
耐藥的出現(xiàn)與頭孢菌素、氨基糖甙類,亞胺培南和其他Beta-內(nèi)酰胺類的治療的關(guān)系:
抗生素治療   治療后耐藥性的出現(xiàn)率n/N(%)  
•  三代頭孢   6/31(19)  
•  氨基糖甙類  1/89(1)  
•  亞胺培南   0/17(0)  
•  其它   0/33(0)
這類菌株三代頭孢菌素使用后出現(xiàn)耐藥較高,而認(rèn)為三代頭孢不適當(dāng)應(yīng)用于腸桿菌屬細(xì)菌的嚴(yán)重感染。
從細(xì)菌耐藥情況可以得出如下結(jié)論
1. 多重耐藥G+感染在增加,尤其是耐萬古霉素菌株的出現(xiàn)和比例的上升是面臨的嚴(yán)峻問題。
2.多重耐藥G-正在醫(yī)院,特別是危重病人增加,給臨床治療造成困難。
3.這種情況的出現(xiàn)主要是由于抗G-桿菌藥物,尤其是三代頭孢菌素及其它口服抗菌藥物的濫用造成的。
4.多重耐藥G+感染的最有效藥物仍是萬古霉素,多重耐藥G-桿菌的最有效藥物是碳青霉烯類。

本篇文章來源于 檢驗(yàn)在線 http://www.labbbs.com/  原文鏈接:http://www.labbbs.com/article/know/xMMDAwMDAwMjIxMA.html

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