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LONZA 龍沙 細(xì)胞 培養(yǎng)基 1、治療級(jí)無(wú)血清間質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng)基 2、X-VIVO 限定化學(xué)成分無(wú)血清造血細(xì)胞培養(yǎng)基 3、ProCHO4 無(wú)蛋白CHO培養(yǎng)基 4、UltraDOMA無(wú)血清雜交瘤細(xì)胞培養(yǎng)基 5、UltraCHO無(wú)血清CHO細(xì)胞培養(yǎng)基 6、UltraCULTURE 無(wú)血清培養(yǎng)基 7、UltraDOMA-PF無(wú)蛋白雜交瘤細(xì)胞培養(yǎng)基 8、Insect-XPRESS無(wú)蛋白昆蟲(chóng)細(xì)胞培養(yǎng)基 9、UltraMEM 低血清培養(yǎng)基 10、UltraMDCK 限定化學(xué)成分無(wú)血清腎細(xì)胞培養(yǎng)基 11、Pro293限定化學(xué)成分無(wú)血清培養(yǎng)基 12、ProFreeze-CDM, NAO, 限定化學(xué)成分凍存培養(yǎng)基(2×) 13、PowerCHO限定化學(xué)成分無(wú)血清CHO培養(yǎng)基 14、ProNS0限定化學(xué)成分無(wú)蛋白質(zhì)培養(yǎng)基 15、HL-1限定化學(xué)成分無(wú)血清培養(yǎng)基 16、PC-1限定化學(xué)成分無(wú)血清培養(yǎng)基 17、Lymphochrome 培養(yǎng)基 18、ProPer1限定化學(xué)成分無(wú)血清培養(yǎng)基 19、ProDoma無(wú)血清雜交瘤細(xì)胞培養(yǎng)基 20、ProVero 1無(wú)血清培養(yǎng)基 21、Cytogenetics Media細(xì)胞遺傳學(xué)培養(yǎng)基 22、PERMEXCIS(TM) 病毒生產(chǎn)培養(yǎng)基（一種PER.C6培養(yǎng)基）
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北京畢特博生物技術(shù)有限責(zé)任公司 http://www.njtrx.cn 400熱線：400-833-9299 QQ：1050524889 傳 真：010-62015131
microRNA(miRNA)是一類(lèi)有大約22個(gè)核苷酸組成的非編碼小分子RNA，其廣泛存在于真核生物中。miRNA在個(gè)體發(fā)育的不同時(shí)期及不同組織中有不同的表達(dá)模式，都表明了其在發(fā)育和分化中起有重大的調(diào)控作用。迄今為此，對(duì)miRNA的檢測(cè)方法主要有Northern Blot 等基于分子雜交的方法，這些方法敏感度低、耗時(shí)長(zhǎng)、RNA的用量較大。miRNA qPCR Detection Kit采用了國(guó)際上公認(rèn)的核酸檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)――Real-Time PCR技術(shù)來(lái)對(duì)miRNA進(jìn)行檢測(cè)，其具有快速、特異性強(qiáng)、靈敏度高等優(yōu)點(diǎn)。
二：背景資料 檢測(cè)人腦組織中miRNA的表達(dá)。所選的miRNA及其擴(kuò)增長(zhǎng)度信息如下：
三：實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 RNA抽提、RNA 加“PolyA”處理、RNA反轉(zhuǎn)錄、定量PCR檢測(cè)及其數(shù)據(jù)分析。 四：實(shí)驗(yàn)主要儀器和試劑 主要實(shí)驗(yàn)儀器:冷凍離心機(jī)、常規(guī)PCR儀、分光光度計(jì)、電泳系統(tǒng) iQ5 Real Time PCR Detection System。 主要實(shí)驗(yàn)試劑:TRIzol（Invitrogen）、RNA級(jí)氯仿、冷凍異丙醇及冷凍的75%乙醇、DEPC滅菌水、液氮、10×Mops、甲醛、10×RNA電泳緩沖液、miRNA qPCR Detection Kit。 五：實(shí)驗(yàn)操作 前期準(zhǔn)備:為避免RNase 對(duì)RNA的降解及其提高實(shí)驗(yàn)的精確性，在實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)準(zhǔn)備好用DEPC處理過(guò)的離心管及其移液槍頭，同時(shí)實(shí)驗(yàn)操作時(shí)，需戴口罩及其一次性手套。所有實(shí)驗(yàn)操作盡可能在冰上進(jìn)行Total RNA抽提。 1、樣品處理:取50mg～200mg樣品直接在液氮中研磨至粉末，再轉(zhuǎn)移一定量至含1mLTRIzol的離心管中，反復(fù)振蕩裂解組織細(xì)胞。（Note：如為貼壁細(xì)胞，去培養(yǎng)基后可直接加入TRIzol(5~10×107細(xì)胞數(shù)加約為1mLTRIzol)，反復(fù)吹打裂解細(xì)胞，再收集TRIzol至離心管中；如為懸浮細(xì)胞，離心收集懸浮細(xì)胞，加入TRIzol(5~10×107細(xì)胞數(shù)加約為1mLTRIzol)反復(fù)吹打裂解細(xì)胞）。 2、相分離:室溫放置上述樣品液10min左右后，每1mLTRIzol 中加入氯仿為200μL，蓋上蓋子，劇烈振蕩約1min，室溫靜置5min，然后12000g 冷凍離心15min（4℃），小心取出樣品，通過(guò)觀察可以發(fā)現(xiàn)樣品分三層，其中最上層含有RNA樣品。 3、RNA沉淀:小心吸取上清液約450μL（每1mLTRIzol 的吸取量）至含有600μL冷凍異丙醇的新離心管中，混勻，12000g 冷凍離心10min（4℃）。 4、RNA洗滌:去上清，加入500μL 冷凍的75％乙醇，彈起沉淀后 12000g 冷凍離心5min（4℃），去上清，再稍離，吸去上清液。 5、RNA溶解:風(fēng)干約5～10min（注意不能風(fēng)太干，只需要沉淀泛白即可），加入DEPC水約30μL。貼上標(biāo)簽后-80℃保存。 6、RNA濃度測(cè)定:吸取1μL 抽提的RNA 用DEPC水稀釋10倍后，在分光光度計(jì)Nanodrop上測(cè)定RNA濃度，以DEPC水做空白對(duì)照，同時(shí)記錄RNA濃度及其OD260/OD280。Note：如為常規(guī)的分光光度計(jì)，注意比色杯測(cè)定時(shí)的最少所需體積量，取一定量的RNA，用DEPC水稀釋約100倍左右，同時(shí)在紫外條件下測(cè)定OD260和OD280，再按照公式計(jì)算RNA濃度＝40ng/μL×OD260×稀釋倍數(shù)）。 7、RNA電泳檢測(cè)： 7.2 電泳緩沖液配制(1×Mops)：取50mL10×Mops ，用去離子水稀釋至500mL，倒入電泳槽中。 7.3 RNA樣品處理：取RNA樣品約3μL，最后補(bǔ)充DEPC水至15μL，65℃變性10min后立即冷卻，加入2μL 10×RNA loading buffer 即可電泳。 7.4 RNA電泳：先把RNA膠放入電泳槽中，100V作用電泳約5min，再在點(diǎn)樣孔中點(diǎn)入處理過(guò)的RNA樣品，100V左右電泳至溴酚藍(lán)至膠的1/3處，取膠拍照。 8、RNA抽提結(jié)果: 8.2 RNA電泳的各泳道所對(duì)應(yīng)的樣品及其樣品濃度和OD 260/OD280。
9、miRNA 3’端進(jìn)行加“Poly A”處理
在反應(yīng)中使用的total RNA必須含有小分子RNA。
Total RNA使用量可在100ng～10μg之間調(diào)整，如使用純化的小分子RNA，其使用量可在10ng～1μg之間調(diào)整。 10、PolyA反應(yīng)： 混勻配制的反應(yīng)mix，短暫離心后在37℃反應(yīng)15min。所得的反應(yīng)液可以直接進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)，也可以放置-20℃短暫保存，如需長(zhǎng)期保存建議存放于-80℃。 11、Poly A化的RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)： 融解反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)所需的試劑，上下輕微顛倒混勻，短暫離心后放置冰上待用。RNA-Primer Mix 的配制反應(yīng)：
混勻RNA-Primer Mix，短暫離心，直接65℃變性10min后立即放置冰上至少2min。
配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液：
在RNA-Primer Mix反應(yīng)管內(nèi)加入以下試劑至總體積25μL。
反轉(zhuǎn)錄反應(yīng): 12、qPCR 檢測(cè)miRNA. miRNA檢測(cè)引物設(shè)計(jì)：miRNA qPCR Detection Kit 中已提供有miRNA檢測(cè)的Reverse 通用引物：“Universal adaptor PCR Primer”，F(xiàn)orward 檢測(cè)引物需客戶參考miRNA序列自行設(shè)計(jì)或直接從我公司定購(gòu)以驗(yàn)證的引物。因?yàn)閙iRNA序列長(zhǎng)度一般都在18～24nt之間，所以其檢測(cè)的 Forward 檢測(cè)引物一般都直接選用其miRNA序列或?yàn)樵黾悠錂z測(cè)的特異性而特殊設(shè)計(jì)的序列：如有的miRNA GC含量偏高或引物易形成引物二聚體，其引物可為miRNA 3’端去除幾個(gè)堿基后整理的序列。 miRNA qPCR Forward Primer 設(shè)計(jì)舉例（以小鼠mmu-miR-125b-5p為例）： 則其Forward 檢測(cè)引物可為：
融解2×qPCR mix(如有必要，融解50×ROX Reference Dye)上下輕微顛倒混勻，短暫離心后放置冰上待用。冰上進(jìn)行qPCR反應(yīng)液的配制（所有miRNA進(jìn)行復(fù)孔測(cè)試，同時(shí)進(jìn)行單孔NTC（No template control）測(cè)試）
1）2×qPCR Mix設(shè)定為總反應(yīng)體積的一半，其它組分請(qǐng)按最適比例進(jìn)行調(diào)整。如需變更總反應(yīng)體積，請(qǐng)保持最適條件下各組分的比例。
2）Rox Reference Dye使用在需要用Rox 校正的Real-Time PCR儀，如ABI的定量PCR儀。 3）引物終濃度可在0.2μM～0.4μM范圍內(nèi)調(diào)整，一般條件下0.2μM的量即可達(dá)到理想的效果。 4）1st Strand cDNA 通常需要稀釋后再使用 ，防止反轉(zhuǎn)錄體系對(duì)qPCR體系的影響。 5）充分混勻qPCR反應(yīng)液，添加至PCR反應(yīng)管中，短暫離心，確保所有試劑到反應(yīng)管底部。 6）qPCR 反應(yīng)，使用標(biāo)準(zhǔn)的三步法進(jìn)行檢測(cè)（以Bio-Rad 的iQ5進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)）。
對(duì)于用SYBR Green 染料法進(jìn)行的qPCR的檢測(cè)的反應(yīng)都需要在循環(huán)結(jié)束后立即進(jìn)行融解曲線分析（以Bio-Rad 的iQ5進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)）
1）、2×qPCR Mix 中采用的DNA聚合酶為經(jīng)過(guò)特殊修飾的熱啟動(dòng)酶，95℃ 10min能充分的激活酶活性。
2）、因miRNA的特殊性從而導(dǎo)致了其引物的特殊性，在檢測(cè)時(shí)應(yīng)嚴(yán)格控制退火溫度，防止出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。 3）、進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄的Oligo dT Adaptor其長(zhǎng)度為53nt，為此PCR擴(kuò)增得到的片段長(zhǎng)度一般在75bp左右（miRNA序列一般為22nt左右），所以延伸只需10sec即可。對(duì)產(chǎn)物的融解曲線判斷可以發(fā)現(xiàn)其Tm值一般都在79℃～83℃范圍內(nèi)，如果超出此范圍，建議使用別的方法來(lái)驗(yàn)證產(chǎn)物的特異性（如電泳）。 以上的反應(yīng)條件主要參考的為Bio-Rad 的iQ5定量PCR儀器，如使用的為不同公司的定量PCR儀，請(qǐng)按照不同的儀器要求，調(diào)整延伸時(shí)間及其融解曲線分析的條件。
六:結(jié)果分析 20個(gè)miRNA及其內(nèi)參U6的擴(kuò)增曲線及其融解曲線結(jié)果 20個(gè)miRNA及其內(nèi)參U6的電泳結(jié)果圖及其檢測(cè)原始平均Ct值
原文地址：MIRNA(microRNA)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)流程(加polyA法)作者：阮阮
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